气相色谱仪毛细管柱流速一般要通过测定柱中无保留气体的线速度的测量，而火焰离子化检测仪用甲烷气或丁烷气测定通过无保留峰的保留时间。柱流速要根据内径、膜的厚度和柱长而定。在具体的分析中还要根据试样样品的分离程度来测定柱流速。分流比则要根据样品浓度和柱负荷来选择。
吹扫气一般为0.5～10ml/min对气相色谱仪来讲比较合适，但具体要根据定量的重复性以及程升基线的漂移情况来确定。吹扫气太小时会降低吹扫作用，致使溶剂峰拖尾或程升基线的漂移严重；吹扫气太大将会影响定量的重复性。而尾吹气在一般情况下，尾吹气ml每分钟+柱流速ml每分钟≈30ml每分钟，当不分流时或柱流速为30ml每分钟左右时可以不加尾吹气。进样分流方式的体积一般为0.1至1ul；而进样不分流方式的体积一般为0.5至3ul。试样样品应含1至10ng的主要组分，对50ng以上的试样样品的组分一般不适用于石英毛细管柱分析。
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